RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FBXW5Q969U6 566 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC35A5Q9BS91 424 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ABCD2Q9UBJ2 740 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GMEB1Q9Y692 573 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 SOX30O94993 753 aa11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 ACVR1BP36896 505 aa11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF141Q15928 474 aa11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SAXO2Q658L1 398 aa11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 SLC43A2Q8N370 569 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HSD17B8Q92506 261 aa11.17□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 NEURL3Q96EH8 262 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CDRT15Q96T59 188 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 LAT2Q9GZY6 243 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR51I1Q9H343 314 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 BCO1Q9HAY6 547 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 LIPT1Q9Y234 373 aa11.17□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CYTIPO60759 359 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DNAJA2O60884 412 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CSTAP01040 98 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CD8AP01732 235 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FESP07332 822 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR12D1P0DN82 309 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 IGHV1-2P23083 117 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 GZMMP51124 257 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MVDP53602 400 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MERTKQ12866 999 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM7Q14002 265 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C16orf62Q7Z3J2 963 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C10orf111Q8N326 155 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RAB8BQ92930 207 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZG16BQ96DA0 208 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 THTPAQ9BU02 230 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TRIM2Q9C040 744 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF350Q9GZX5 532 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GP6Q9HCN6 339 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ADA2Q9NZK5 511 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 CLDN24A6NM45 220 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SHISA9B4DS77 424 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ADAM11O75078 769 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 STX11O75558 287 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PDE5AO76074 875 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 KRT75O95678 551 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 IGHV4-39P01824 125 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GPX2P18283 190 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NTF4P34130 210 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RYKP34925 604 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PGM1P36871 562 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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