Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGADQ13349 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITGADQ13349 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ITGADQ13349 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ITGADQ13349 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGADQ13349 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGADQ13349 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGADQ13349 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ITGADQ13349 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGADQ13349 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGADQ13349 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGADQ13349 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGADQ13349 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGADQ13349 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGADQ13349 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ITGADQ13349 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGADQ13349 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGADQ13349 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGADQ13349 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGADQ13349 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGADQ13349 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGADQ13349 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGADQ13349 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGADQ13349 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGADQ13349 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGADQ13349 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGADQ13349 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGADQ13349 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGADQ13349 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGADQ13349 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGADQ13349 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGADQ13349 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGADQ13349 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGADQ13349 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGADQ13349 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITGADQ13349 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGADQ13349 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGADQ13349 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGADQ13349 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGADQ13349 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGADQ13349 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGADQ13349 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGADQ13349 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGADQ13349 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGADQ13349 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGADQ13349 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGADQ13349 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGADQ13349 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGADQ13349 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGADQ13349 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGADQ13349 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGADQ13349 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGADQ13349 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGADQ13349 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGADQ13349 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGADQ13349 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGADQ13349 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITGADQ13349 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGADQ13349 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGADQ13349 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGADQ13349 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGADQ13349 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGADQ13349 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGADQ13349 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGADQ13349 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGADQ13349 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGADQ13349 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGADQ13349 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGADQ13349 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGADQ13349 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGADQ13349 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ITGADQ13349 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ITGADQ13349 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGADQ13349 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGADQ13349 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGADQ13349 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ITGADQ13349 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGADQ13349 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGADQ13349 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGADQ13349 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGADQ13349 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGADQ13349 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGADQ13349 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGADQ13349 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGADQ13349 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGADQ13349 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGADQ13349 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGADQ13349 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGADQ13349 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGADQ13349 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms