RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	BCO1	Q9HAY6	547 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FANCF	Q9NPI8	374 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RLIM	Q9NVW2	624 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ARMCX1	Q9P291	453 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		7.48	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ZNF724	A8MTY0	619 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128		A8MXE2	369 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	C19orf84	I3L1E1	186 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CXCL13	O43927	109 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CYTIP	O60759	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KRT34	O76011	436 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	AQP8	O94778	261 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FAM107A	O95990	144 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CGA	P01215	116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	IFNA14	P01570	189 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PNMT	P11086	282 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SHC1	P29353	583 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TACR3	P29371	465 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	AGTR1	P30556	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	DIO1	P49895	249 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SLC16A1	P53985	500 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	NCALD	P61601	193 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	H3F3A	P84243	136 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FOXF2	Q12947	444 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RABL3	Q5HYI8	236 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	FCRLA	Q7L513	359 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	OSTF1	Q92882	214 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	C3orf49	Q96BT1	292 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	RCN3	Q96D15	328 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	STARD4	Q96DR4	205 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	OR5B2	Q96R09	309 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ZNF559	Q9BR84	538 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	UCK2	Q9BZX2	261 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TRIM2	Q9C040	744 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	PIF1	Q9H611	641 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
USP34-208	ENST00000467128		A0A0B4J2E0	115 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128		A0A1B0GX12	115 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128		A8MVM7	634 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	SULT2B1	O00204	365 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	NPIPB7	O75200	414 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	PRKD3	O94806	890 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	LGI1	O95970	557 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	GPI	P06744	558 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	GKN3P	P0CG01	181 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	ENPP1	P22413	925 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	CXCR1	P25024	350 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	SSTR2	P30874	369 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	KCNJ5	P48544	419 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	DMTN	Q08495	405 aa		7.46	□□□□□ -1.22
USP34-208	ENST00000467128	MYBPH	Q13203	477 aa		7.46	□□□□□ -1.22

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