RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 KRT16P08779 473 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PAX1P15863 534 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ADH6P28332 368 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 QPRTQ15274 297 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF621Q6ZSS3 439 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PGAM4Q8N0Y7 254 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SFXN5Q8TD22 340 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DNAJA3Q96EY1 480 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MDFIQ99750 246 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 BTBD10Q9BSF8 475 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR10A4Q9H209 315 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C1orf21Q9H246 121 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CXorf56Q9H5V9 222 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FANCFQ9NPI8 374 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TIGARQ9NQ88 270 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MKLN1Q9UL63 735 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RNF115Q9Y4L5 304 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 H3BNH8 94 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GYG2O15488 501 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF264O43296 627 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 LYZL6O75951 148 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 UBL4AP11441 157 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A2P23975 617 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 IL32P24001 234 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A1P30825 629 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CDKN1AP38936 164 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RASSF2P50749 326 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SELPLGQ14242 412 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GPR68Q15743 365 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RABL3Q5HYI8 236 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C16orf89Q6UX73 402 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ASRGL1Q7L266 308 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DEFB107AQ8IZN7 70 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR5W2Q8NH69 310 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD27Q96NW4 1050 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OR5B2Q96R09 309 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PSD2Q9BQI7 771 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NANOGQ9H9S0 305 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CMTM6Q9NX76 183 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NDE1Q9NXR1 346 aa11.19□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DPRXA6NFQ7 191 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SERINC4A6NH21 518 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 GJE1A6NN92 205 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RNF223E7ERA6 249 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 OVOL3O00110 214 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RAMP1O60894 148 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NDUFS7O75251 213 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ANP32DO95626 131 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CD3EP07766 207 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DANCRP0C864 163 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PTNP21246 168 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MATN1P21941 496 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 UQCRC2P22695 453 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC7A2P52569 658 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MTPNP58546 118 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 BSPH1Q075Z2 132 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 FAPQ12884 760 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SELENBP1Q13228 472 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SKP2Q13309 424 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 STK11Q15831 433 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 MAPK14Q16539 360 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ADAM5Q6NVV9 412 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C6orf120Q7Z4R8 191 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.18□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms