RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCF1Q9UBD9 225 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNPEPQ9ULA0 475 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNK6Q9Y257 313 aa-2.12□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPW3 197 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDR42E2A6NKP2 422 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFNGO00587 321 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYT7O43581 403 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDS2O95674 445 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-DQB1P01920 261 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 P04436 131 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPX1P07203 203 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAMP2P13473 410 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTAFRP25105 342 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGEA8P43361 318 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACOT2P49753 483 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLK7P49862 253 aa-2.13□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRMT9Q6P2P2 845 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSDL2Q6YN16 418 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM47EQ6ZV65 393 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT74Q7RTS7 529 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A45Q8N413 288 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 C15orf40Q8WUR7 153 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 COG3Q96JB2 828 aa-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP-2.13□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-2.13□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC28Q96AY4 2481 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 HELTA6NFD8 242 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 MANBAO00462 879 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 EI24O14681 340 aa-2.14□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 YIF1AO95070 293 aa-2.14□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 AP1ARQ63HQ0 302 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 IKBIPQ70UQ0 350 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A11Q8NBS3 891 aa-2.14□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8U1Q8NH10 309 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHC3Q92529 594 aa-2.14□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR62O43379 1518 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-2.14□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFASO15067 1338 aa-2.15□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ERCC8Q13216 396 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SMUG1Q53HV7 270 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB41Q5JT25 222 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCTD16Q68DU8 428 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-2.15□□□□□ -2.75
RNU6-871P-201ENST00000516122 PVRIGQ6DKI7 326 aa-2.15□□□□□ -2.75
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