RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592175.5

KDM4B-210, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 4

Gene KDM4B, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-210ENST00000592175 TNFSF11O14788 317 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 OIP5O43482 229 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 NTN1O95631 604 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 PGCP20142 388 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 CCR4P51679 360 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 CASP9P55211 416 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 CARD18P57730 90 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 STX1BP61266 288 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 SELENBP1Q13228 472 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 GPAT3Q53EU6 434 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 CMIPQ8IY22 773 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 OSTF1Q92882 214 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 ITCHQ96J02 903 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 NPAS1Q99742 590 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 INPP5KQ9BT40 448 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 FANCFQ9NPI8 374 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.65□□□□□ -0.06
KDM4B-210ENST00000592175 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 A0A0J9YW62 118 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 FAM234BA2RU67 622 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 C9JVG2 144 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CXCL13O43927 109 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 AQP8O94778 261 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 H6PDO95479 791 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 IL11P20809 199 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CPOXP36551 454 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CD79BP40259 229 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CDKN2CP42773 168 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CTBP2P56545 445 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 FUT5Q11128 374 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 GNA13Q14344 377 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 QPRTQ15274 297 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 VWA1Q6PCB0 445 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 GP6Q9HCN6 339 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 PROCRQ9UNN8 238 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 MPDZO75970 2070 aa14.64□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SH3D21A4FU49 640 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 ANP32DO95626 131 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CGAP01215 116 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SFTPDP35247 375 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 PGM1P36871 562 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SLC6A8P48029 635 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 PPP2R2AP63151 447 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SIRPAP78324 504 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 KCNJ10P78508 379 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 ZFP90Q8TF47 636 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 MARK4Q96L34 752 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CALML5Q9NZT1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 ABCA4P78363 2273 aa14.63□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 AGAP5A6NIR3 686 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CASKO14936 926 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 EFNA2O43921 213 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 CYP7B1O75881 506 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 OPN1LWP04000 364 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 GSNP06396 782 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 NR2F1P10589 423 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 SLC7A1P30825 629 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 KCNJ5P48544 419 aa14.62□□□□□ -0.07
KDM4B-210ENST00000592175 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms