RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOBTB1O94844 696 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANP32DO95626 131 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNA14O95837 355 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHDP01880 384 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PFN1P07737 140 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETSIPP0DME0 302 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV1-8P0DP01 117 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGEA3P43357 314 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL29P47914 159 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MORC3Q14149 939 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNJ11Q14654 390 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPAT3Q53EU6 434 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEDAGQ5VYS4 303 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF470Q6ECI4 717 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRMPD2BQ6IN97 320 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMPPEQ6ZT21 453 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAATS1Q7Z4T9 603 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TC2NQ8N9U0 490 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 VIPAS39Q9H9C1 493 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A19Q9HC21 320 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS54Q9P1Q0 977 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF492Q9P255 531 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAMA5O15230 3695 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NF1P21359 2839 aa-1.98□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GUH1 482 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLN5O75503 358 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDE5AO76074 875 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OXTP01178 125 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 RB1P06400 928 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTSGP08311 255 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ICAM2P13598 275 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERCC2P18074 760 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OMGP23515 440 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSTR1P30872 391 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASMTP46597 345 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SULT2A1Q06520 285 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF763Q0D2J5 394 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 P2RY14Q15391 338 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CPTPQ5TA50 214 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF620Q6ZNG0 422 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZRG5 221 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRTM4Q86VH4 590 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01560Q8TB33 94 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS39Q96JC1 886 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM121Q9BTD3 319 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC45AQ9H3U1 944 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXO8Q9NRD0 319 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCL28Q9NRJ3 127 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAGE1Q9NXZ1 904 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIMAP2Q9UG22 337 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIEZO1Q92508 2521 aa-1.99□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP6P35125 1406 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PNM2 257 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPAN2O60636 221 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-DQA1P01909 254 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALPPL2P10696 532 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF18P17022 549 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GJB2P29033 226 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCKP35557 465 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 CX3CR1P49238 355 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 VAMP2P63027 116 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC7A9P82251 487 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOLH1Q04609 750 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf54Q08AI8 447 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 BRD3Q15059 726 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLHL35Q6PF15 583 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNM1P46Q6ZS02 220 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa-2□□□□□ -2.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 BIVMQ86UB2 503 aa-2□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms