RNA–Protein interactions for RNA: YMR053C

STB2, Transcript of Protein that interacts with Sin3p in a two-hybrid assay, yeast

Gene STB2, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB2	YMR053C	POL31	P46957	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YGR153W	P48238	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SWD1	P39706	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GNP1	P48813	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CWH41	P53008	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MET13	P53128	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SSL2	Q00578	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
STB2	YMR053C	TIM50	Q02776	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PHO92	Q06390	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SSM4	P40318	1319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NTG1	P31378	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GUT2	P32191	649 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	UIP5	P36137	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RDH54	P38086	958 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	IMA5	P40884	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YJR096W	P47137	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PMT7	Q06644	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	APL4	Q12028	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YRM1	Q12340	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	OM45	P16547	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TEC1	P18412	486 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VBA3	P25594	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PCL2	P25693	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	FUN30	P31380	1131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DBF4	P32325	704 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	UGA4	P32837	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	CCC2	P38995	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DSS1	P39112	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NNF2	P53253	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RRN5	Q02983	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ERF2	Q06551	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SEM1	O94742	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DAL7	P21826	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RSC6	P25632	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NUD1	P32336	851 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	DAL3	P32459	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MDL1	P33310	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YJL068C	P40363	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ALR2	P43553	858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VPS53	P47061	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VPS4	P52917	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	COG8	Q04632	607 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	NFI1	Q12216	726 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PRP28	P23394	588 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	MIH1	P23748	554 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
STB2	YMR053C	ERG3	P32353	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SWH1	P35845	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	FIG4	P42837	879 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	SAP155	P43612	1002 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	PNG1	Q02890	363 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	ADI1	Q03677	179 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	BLS1	Q06071	122 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	GGA1	Q06336	557 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	VHS3	Q08438	674 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB2	YMR053C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB2	YMR053C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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