RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
MRP17	YKL003C	ADK2	P26364	225 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RFC5	P38251	354 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YEL076C	P39971	216 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	HEH2	Q03281	663 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PCD1	Q12524	340 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SMC6	Q12749	1114 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	CDC4	P07834	779 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	POL3	P15436	1097 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ALG1	P16661	449 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RPC31	P17890	251 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ASF1	P32447	279 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YAP1801	P38856	637 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YFL052W	P43551	465 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	JJJ3	P47138	172 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	MMR1	Q06324	491 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YLH47	Q06493	454 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PSK2	Q08217	1101 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ELG1	Q12050	791 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YPL150W	Q12152	901 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	HIF1	Q12373	385 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	CSE2	P33308	149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	GCS1	P35197	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PET10	P36139	283 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	APN2	P38207	520 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SIP3	P38717	1229 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	FYV10	P40492	516 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ROG3	P43602	733 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	CBK1	P53894	756 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YNL146W	P53906	100 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	VPS20	Q04272	221 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	IES4	Q08561	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	HFI1	Q12060	488 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YOR022C	Q12204	715 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	TOR1	P35169	2470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	GLN3	P18494	730 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ATG19	P35193	415 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RDH54	P38086	958 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	BUD16	P39988	312 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ESL1	P40456	1118 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YGL081W	P53156	320 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ENV11	P53246	860 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RTT102	P53330	157 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YNR014W	P53719	212 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	RLF2	Q12495	606 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ZPS1	Q12512	249 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SYN8	P31377	255 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	DPH2	P32461	534 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	COT1	P32798	439 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PEX2	P32800	271 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	MAL33	P38157	468 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	THI6	P41835	540 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	LAM5	P43560	674 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	NPA3	P47122	385 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	UBA2	P52488	636 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	GUP1	P53154	560 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SPO71	Q03868	1245 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	HED1	Q03937	162 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	YDL057W	Q07379	328 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MRP17	YKL003C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.21	□□□□□ -1.42	not detected
MRP17	YKL003C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	MBR1	P23493	339 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	BUD2	P33314	1104 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	MRPL7	P36519	292 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	VID24	P38263	362 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	NUP82	P40368	713 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	YIR016W	P40572	265 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	VID30	P53076	958 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	TAM41	P53230	385 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	LCD1	Q04377	747 aa		6.21	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	CKA2	P19454	339 aa		6.2	□□□□□ -1.42
MRP17	YKL003C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42

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