RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY2B-BQ12491 1770 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-ORQ92393 1755 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.46□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C YKL151CP36059 337 aa3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C PPS1P38148 807 aa3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C SNF7P39929 240 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C SRT1Q03175 343 aa3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C SPR28Q04921 423 aa3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C SUT2Q12286 268 aa3.45□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-HO13535 1793 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-JR1P47098 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-ER1Q03612 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-GR2Q12269 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-OLQ12273 1755 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C DNF1P32660 1571 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C YTA7P40340 1379 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ATE1P16639 503 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C HRQ1Q05549 1077 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C SPP41P38904 1435 aa3.44□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C MYO4P32492 1471 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C MET6P05694 767 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C KIN3P22209 435 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C DMC1P25453 334 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C LYP1P32487 611 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C GIC1P38785 314 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C FYV10P40492 516 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C POL32P47110 350 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C RKM4Q12504 494 aa3.43□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ORC2P32833 620 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C STB2P46679 850 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ADY4Q05955 493 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C PEX19Q07418 342 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C YPL066WQ12194 479 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C MET5P47169 1442 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TRM732Q03496 1420 aa3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C VTH1P40438 1549 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C VTH2P40890 1549 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TRP2P00899 507 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C CAF20P12962 161 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ADY2P25613 283 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C STE14P32584 239 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C FLO10P36170 1169 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ELO3P40319 345 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C ERG5P54781 538 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C TSC11P40061 1430 aa3.41□□□□□ -1.86
GCN4YEL009C MGE1P38523 228 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C GAT1P43574 510 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C DAM1P53267 343 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RIA1P53893 1110 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TRM13Q12383 476 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TRM11Q12463 433 aa3.4□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C INO1P11986 533 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RGT1P32862 1170 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C DUT1P33317 147 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SLD2P34252 453 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C MOT2P34909 587 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C CTF13P35203 478 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C NPP2P39997 493 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C YJR107WP47145 328 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C MRPS35P53292 345 aa3.39□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
GCN4YEL009C SPO11P23179 398 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C YKL107WP34251 309 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RAI1P53063 387 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TYW3P53177 273 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C EEB1Q02891 456 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C NUP159P40477 1460 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C TY1B-BLQ12490 1755 aa3.38□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C NTE1Q04958 1679 aa3.37□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C YGL176CP46945 554 aa3.37□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C PUS2P53167 370 aa3.37□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C RMD1Q03441 430 aa3.37□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
GCN4YEL009C STH1P32597 1359 aa3.37□□□□□ -1.87
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