RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	MRP8	P35719	219 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	NCS6	P53088	359 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TPO2	P53283	614 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	ADE8	P04161	214 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	YRO2	P38079	344 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	YOR1	P53049	1477 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	CDC25	P04821	1589 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	NPP1	P25353	742 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	SED4	P25365	1065 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	PBY1	P38254	753 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	CTF4	Q01454	927 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	KAR4	P25583	335 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SLX1	YBR228W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	CHS7	P38843	316 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	IRR1	P40541	1150 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	ENB1	Q08299	606 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	VPS30	Q02948	557 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	UPC2	Q12151	913 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	LAS17	Q12446	633 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	SMC4	Q12267	1418 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	CHD1	P32657	1468 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	STE5	P32917	917 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	ERT1	P38140	529 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	YBR184W	P38299	523 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	AFR1	P33304	620 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	RPD3	P32561	433 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	SUL1	P38359	859 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	GUP2	Q08929	609 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	RAD53	P22216	821 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	STE13	P33894	931 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	ALR2	P43553	858 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SLX1	YBR228W	PAN1	P32521	1480 aa		6.34	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	SIT1	P39980	628 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YLR040C	Q07988	224 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	MYO4	P32492	1471 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	MMS22	Q06164	1454 aa		6.33	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YTA7	P40340	1379 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	DNF1	P32660	1571 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YBR284W	P38150	797 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	CEP3	P40969	608 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YKE2	P52553	114 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	GIS1	Q03833	894 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	LCD1	Q04377	747 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	CDC11	P32458	415 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TOK1	P40310	691 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	PPM2	Q08282	695 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YPR071W	Q12346	211 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	STE14	P32584	239 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	PFD1	P46988	109 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	BUL1	P48524	976 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	UBA2	P52488	636 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	UBX5	Q06682	500 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YOL073C	Q08232	322 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	SPP41	P38904	1435 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	REC104	P33323	182 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	MOH1	P38191	138 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	YMR206W	Q03695	313 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	PEX19	Q07418	342 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	ERG4	P25340	473 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	OAR1	P35731	278 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	EAF1	Q06337	982 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	FMP25	Q08023	583 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SLX1	YBR228W	VTH1	P40438	1549 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SLX1	YBR228W	VTH2	P40890	1549 aa		6.27	□□□□□ -1.41

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