RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.79■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.78■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 SOGA3Q5TF21 947 aa28.78■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 RNF181Q9P0P0 153 aa28.78■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 RASSF7Q02833 373 aa28.77■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 NLRP3Q96P20 1036 aa28.77■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
SYT6-210ENST00000641643 CRY2Q49AN0 593 aa28.76■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.75■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.75■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 LMNB1P20700 586 aa28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 MIER1Q8N108 512 aa28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.74■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.73■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 NFKBIEO00221 500 aa28.72■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 SLX4Q8IY92 1834 aa28.72■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 SLC4A2P04920 1241 aa28.71■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 ZNF428Q96B54 188 aa28.71■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 CCDC93Q567U6 631 aa28.71■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 TAOK3Q9H2K8 898 aa28.71■■■□□ 2.19
SYT6-210ENST00000641643 VAMP4O75379 141 aa28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 MYD88Q99836 296 aa28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 CACNA1SQ13698 1873 aa28.7■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.69■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 ZNF521Q96K83 1311 aa28.68■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.68■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 KSR2Q6VAB6 950 aa28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 SYNE4Q8N205 404 aa28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 FAM89AQ96GI7 184 aa28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 CRAMP1Q96RY5 1269 aa28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.67■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 SBF1O95248 1867 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 RTKN2Q8IZC4 609 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.66■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 PRELPP51888 382 aa28.64■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.64■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.64■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SYT6-210ENST00000641643 FLIIQ13045 1269 aa28.63■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.63■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 G2E3Q7L622 706 aa28.63■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 E9PSI1 815 aa28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 OLFM4Q6UX06 510 aa28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.61■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 ABCC4O15439 1325 aa28.59■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 BBOX1O75936 387 aa28.58■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 C1QTNF8P60827 252 aa28.58■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 GRIPAP1Q4V328 841 aa28.58■■■□□ 2.17
SYT6-210ENST00000641643 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.58■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.57■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 CACNA1FO60840 1977 aa28.56■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 GRAPQ13588 217 aa28.55■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.55■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 GLTPD2A6NH11 291 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 IGKV5-2P06315 115 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 SLFN5Q08AF3 891 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 PSMD1Q99460 953 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 NMRK2Q9NPI5 230 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 KIF3CO14782 793 aa28.54■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.52■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 IARSP41252 1262 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
SYT6-210ENST00000641643 PDE8AO60658 829 aa28.51■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 SP8Q8IXZ3 490 aa28.51■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 RRAGCQ9HB90 399 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.4 ms