RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	KIF2C	Q99661	725 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SIL1	Q9H173	461 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TJP1	Q07157	1748 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SGSM2	O43147	1006 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CIAO1	O76071	339 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SASH1	O94885	1247 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5J	P18859	108 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NEK4	P51957	841 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	AK7	Q96M32	723 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ARX	Q96QS3	562 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	FSD1	Q9BTV5	496 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	JCAD	Q9P266	1359 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	HSPA4	P34932	840 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	KCNJ4	P48050	445 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CASP7	P55210	303 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	GSE1	Q14687	1217 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SLIT2	O94813	1529 aa		10.02	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	EYA2	O00167	538 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PSMA5	P28066	241 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PIP4K2B	P78356	416 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	FOXO4	P98177	505 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	TFCP2	Q12800	502 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		10.02	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	MCM4	P33991	863 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	KRT32	Q14532	448 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	MYH3	P11055	1940 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	ABCC12	Q96J65	1359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0G2JS52	829 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	RGL2	O15211	777 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	DDIT3	P35638	169 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	ANKRD1	Q15327	319 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	VPS72	Q15906	364 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
PNKP-231	ENST00000640501	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10	□□□□□ -0.81

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