RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 TAF5LO75529 589 aa9□□□□□ -0.97
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PKP4-217ENST00000628904 VPS37DQ86XT2 251 aa9□□□□□ -0.97
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PKP4-217ENST00000628904 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 IFT172Q9UG01 1749 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.94□□□□□ -0.98
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PKP4-217ENST00000628904 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-217ENST00000628904 KDRP35968 1356 aa8.94□□□□□ -0.98
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