RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MARK1Q9P0L2 795 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP20Q9Y2K6 914 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMC2Q13753 1193 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATCAYQ86WG3 371 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABTB2Q8N961 1025 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CD33P20138 364 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MX2P20592 715 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZAP70P43403 619 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARSDP51689 593 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BRB1 525 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM13AO94988 1023 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM182BQ5T319 152 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC30A3Q99726 388 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MBIPQ9NS73 344 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FZD6O60353 706 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARHGAP4P98171 946 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR152Q8TDT2 470 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GSX2Q9BZM3 304 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGF1RP08069 1367 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 BMP4P12644 408 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 EDEM1Q92611 657 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 KLF15Q9UIH9 416 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADAMTS2O95450 1211 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPB42P16452 691 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPEM2Q0P670 501 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 WIPF1O43516 503 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 EGFRP00533 1210 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDGFAP04085 211 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLURP2P0DP57 97 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP2K3P46734 347 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 AAMPQ13685 434 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCINQ13939 588 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 POLIQ9UNA4 740 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 XYLBO75191 536 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SASH3O75995 380 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 BHMTQ93088 406 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACDQ96AP0 544 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SYT9Q86SS6 491 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 WHAMMQ8TF30 809 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZFATQ9P243 1243 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 A6NHS1 94 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARAFP10398 606 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 NFKB1P19838 968 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 C8orf34Q49A92 452 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 XKR5Q6UX68 686 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 EFCC1Q9HA90 598 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 GGA1Q9UJY5 639 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIN3BO75182 1162 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCSK2P16519 638 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms