RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 MARK1Q9P0L2 795 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 USP20Q9Y2K6 914 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LAMC2Q13753 1193 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATCAYQ86WG3 371 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABTB2Q8N961 1025 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.56□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 MX2P20592 715 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZAP70P43403 619 aa6.55□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 MBIPQ9NS73 344 aa6.54□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 ARHGAP4P98171 946 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR152Q8TDT2 470 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GSX2Q9BZM3 304 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGF1RP08069 1367 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-87P-201ENST00000607561 EDEM1Q92611 657 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.52□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 EPB42P16452 691 aa6.51□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 SPEM2Q0P670 501 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.51□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.51□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 WIPF1O43516 503 aa6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 PDGFAP04085 211 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLURP2P0DP57 97 aa6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 AAMPQ13685 434 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCINQ13939 588 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 SYT9Q86SS6 491 aa6.48□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-87P-201ENST00000607561 C8orf34Q49A92 452 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 XKR5Q6UX68 686 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 EFCC1Q9HA90 598 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 GGA1Q9UJY5 639 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIN3BO75182 1162 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-87P-201ENST00000607561 PCSK2P16519 638 aa6.45□□□□□ -1.38
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