RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 SYNE4Q8N205 404 aa26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 JMYQ8N9B5 988 aa26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.24■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 KRT24Q2M2I5 525 aa26.23■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 COPS6Q7L5N1 327 aa26.23■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 PSMD1Q99460 953 aa26.23■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.22■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 NECTIN2Q92692 538 aa26.22■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 IFFO2Q5TF58 517 aa26.21■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.21■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MFGE8-208ENST00000558773 FZD9O00144 591 aa26.2■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.2■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 NLRP3Q96P20 1036 aa26.2■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 SCN4AP35499 1836 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 CHADLQ6NUI6 762 aa26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 HOXB7P09629 217 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 POTEIP0CG38 1075 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 POTEJP0CG39 1038 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 TCIRG1Q13488 830 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 CFAP44Q96MT7 982 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.18■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 NLRP10Q86W26 655 aa26.17■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.15■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF853P0CG23 659 aa26.14■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.14■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 SLC51AQ86UW1 340 aa26.14■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 JDP2Q8WYK2 163 aa26.14■■□□□ 1.78
MFGE8-208ENST00000558773 COL4A5P29400 1685 aa26.13■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 LDHDQ86WU2 507 aa26.13■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 GPC2Q8N158 579 aa26.13■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.12■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 MBIPQ9NS73 344 aa26.12■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 HACL1Q9UJ83 578 aa26.12■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.12■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 APAF1O14727 1248 aa26.11■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.11■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC4O15439 1325 aa26.11■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 PCNTO95613 3336 aa26.11■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.1■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 LAMB2P55268 1798 aa26.1■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 BBOX1O75936 387 aa26.09■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.09■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.09■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 PASKQ96RG2 1323 aa26.09■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 EPHX2P34913 555 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 VPS33BQ9H267 617 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 CREBZFQ9NS37 354 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 HYPKQ9NX55 129 aa26.08■■□□□ 1.77
MFGE8-208ENST00000558773 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 IFT57Q9NWB7 429 aa26.07■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 SP8Q8IXZ3 490 aa26.06■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 GNAI1P63096 354 aa26.05■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 GRAPQ13588 217 aa26.03■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.03■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.03■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.02■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 PPIP5K2O43314 1243 aa26.02■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 NIM1KQ8IY84 436 aa26.02■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.02■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
MFGE8-208ENST00000558773 SCNN1DP51172 638 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 LTBP1Q14766 1721 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 AOC3Q16853 763 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 MPNDQ8N594 471 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF428Q96B54 188 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 FAM89AQ96GI7 184 aa26.01■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC184Q52MB2 194 aa26■■□□□ 1.75
MFGE8-208ENST00000558773 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
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