RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 TCIRG1Q13488 830 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 NLRP10Q86W26 655 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 WDR63Q8IWG1 891 aa22.94■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 CACNA1FO60840 1977 aa22.93■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.93■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.92■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 RNF181Q9P0P0 153 aa22.92■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.91■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 SNED1Q8TER0 1413 aa22.9■■□□□ 1.26
CS-219ENST00000550655 LMNB1P20700 586 aa22.89■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 ZNF521Q96K83 1311 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 GOLGA2Q08379 1002 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 SYNE4Q8N205 404 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 TAF1P21675 1872 aa22.87■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 ALDH1B1P30837 517 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 SOGA3Q5TF21 947 aa22.86■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 CCER2I3L3R5 266 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 OLFM4Q6UX06 510 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 ZNF428Q96B54 188 aa22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 CCDC93Q567U6 631 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 NLRP3Q96P20 1036 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.84■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 STK31Q9BXU1 1019 aa22.83■■□□□ 1.25
CS-219ENST00000550655 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 C1QTNF8P60827 252 aa22.82■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 COL4A1P02462 1669 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 KIF3CO14782 793 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 VAMP4O75379 141 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 G2E3Q7L622 706 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 SLC51AQ86UW1 340 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 MYD88Q99836 296 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.81■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 FAM89AQ96GI7 184 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 ABCC4O15439 1325 aa22.8■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 WDR90Q96KV7 1748 aa22.79■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 MYH3P11055 1940 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 SLC4A2P04920 1241 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 KSR2Q6VAB6 950 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.77■■□□□ 1.24
CS-219ENST00000550655 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 COL4A5P29400 1685 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 IGKV5-2P06315 115 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 FLIIQ13045 1269 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 PSMD1Q99460 953 aa22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 GLTPD2A6NH11 291 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 LTBP1Q14766 1721 aa22.74■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 GRAPQ13588 217 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.72■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 SPEF2Q9C093 1822 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-219ENST00000550655 E9PSI1 815 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-219ENST00000550655 BBOX1O75936 387 aa22.7■■□□□ 1.22
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