RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP10	Q86W26	655 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	NTSR2	O95665	410 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.85	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	DPEP1	P16444	411 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	PLIN1	O60240	522 aa		11.83	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.82	□□□□□ -0.52	1e-10	■□□□□ 10.7
MLH1-222	ENST00000539477	KCNA3	P22001	575 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ST5	P78524	1137 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	OLFM4	Q6UX06	510 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM27	P14373	513 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.81	□□□□□ -0.52	6e-8	■■■□□ 16.7
MLH1-222	ENST00000539477	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.81	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.8	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	PARP10	Q53GL7	1025 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	RLBP1	P12271	317 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	GCKR	Q14397	625 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.79	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CHD4	Q14839	1912 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	SRGN	P10124	158 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	GPR162	Q16538	588 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	PTPRC	P08575	1304 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	SBF1	O95248	1867 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
MLH1-222	ENST00000539477		H0YIN7	160 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	RGL2	O15211	777 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PDE6B	P35913	854 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	TGFB2	P61812	414 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	C21orf2	O43822	256 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	CASP7	P55210	303 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	ABCC4	O15439	1325 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	GRM8	O00222	908 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	MEIS3	Q99687	375 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	GREM2	Q9H772	168 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	RASSF7	Q02833	373 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MLH1-222	ENST00000539477	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53

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