RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-208	ENST00000538923	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	FSTL1	Q12841	308 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	COL15A1	P39059	1388 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	TJP1	Q07157	1748 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	HMOX1	P09601	288 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	FBXW7	Q969H0	707 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	NARF	Q9UHQ1	456 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MRE11-208	ENST00000538923	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	NFIX	Q14938	502 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	SERPINB2	P05120	415 aa		12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	RRAGC	Q9HB90	399 aa		12	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	STARD3NL	O95772	234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	LMNB1	P20700	586 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	OSBP	P22059	807 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	RASSF7	Q02833	373 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923		A0A087WZG4	1122 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923		H0YIN7	160 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	MAP3K7	O43318	606 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	TEF	Q10587	303 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	PDE6B	P35913	854 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	HTRA3	P83110	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MRE11-208	ENST00000538923	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	PTPRE	P23469	700 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	PBX2	P40425	430 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	NFKBIE	O00221	500 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	PRELP	P51888	382 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	NPHP1	O15259	732 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	C21orf2	O43822	256 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MRE11-208	ENST00000538923	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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