RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
TTC13-208	ENST00000522399	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC13-208	ENST00000522399	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.27	■■■□□ 2.76
TTC13-208	ENST00000522399	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	PSMD1	Q99460	953 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	SCN4A	P35499	1836 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	HOXB7	P09629	217 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TTC13-208	ENST00000522399	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	CFAP44	Q96MT7	982 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.17	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	FZD9	O00144	591 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	TCIRG1	Q13488	830 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	LDHD	Q86WU2	507 aa		32.14	■■■□□ 2.74
TTC13-208	ENST00000522399	PCNT	O95613	3336 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	GPC2	Q8N158	579 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	MBIP	Q9NS73	344 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	LAMB2	P55268	1798 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	APAF1	O14727	1248 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.11	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		32.1	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	ABCC4	O15439	1325 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	EPHX2	P34913	555 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	GNAI1	P63096	354 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TTC13-208	ENST00000522399	BBOX1	O75936	387 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.07	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	COL4A5	P29400	1685 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	VPS33B	Q9H267	617 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.05	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		32.03	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	SP8	Q8IXZ3	490 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.01	■■■□□ 2.72
TTC13-208	ENST00000522399	GRAP	Q13588	217 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	AOC3	Q16853	763 aa		32	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF428	Q96B54	188 aa		32	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	TMC4	Q7Z404	712 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	MPND	Q8N594	471 aa		31.99	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.98	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.98	■■■□□ 2.71

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