RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 LAMB2P55268 1798 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 NTSR2O95665 410 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 TTLL6Q8N841 843 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 SLX4Q8IY92 1834 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 NLRP10Q86W26 655 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 MYD88Q99836 296 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 SLFN5Q08AF3 891 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 MASTLQ96GX5 879 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 FLIIQ13045 1269 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 G2E3Q7L622 706 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PITX1-204ENST00000504936 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 SRGNP10124 158 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 NPR1P16066 1061 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 STYK1Q6J9G0 422 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 CNKSR1Q969H4 720 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 KSR2Q6VAB6 950 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.31■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 SBF1O95248 1867 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 MYH3P11055 1940 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.3■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 ADCY9O60503 1353 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 NLRP3Q96P20 1036 aa24.29■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 TAF1P21675 1872 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.28■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 C21orf2O43822 256 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 SYNE4Q8N205 404 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 FAM89AQ96GI7 184 aa24.27■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PITX1-204ENST00000504936 ALDH1B1P30837 517 aa24.25■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 RASSF7Q02833 373 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.24■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 CRY2Q49AN0 593 aa24.23■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.22■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 F6X3S4 739 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 SOGA3Q5TF21 947 aa24.21■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PITX1-204ENST00000504936 SPEF2Q9C093 1822 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 IGKV5-2P06315 115 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 RNF181Q9P0P0 153 aa24.2■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 CCDC93Q567U6 631 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.19■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 ABCC4O15439 1325 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.17■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 OLFM4Q6UX06 510 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 LINS1Q8NG48 757 aa24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 NFKBIEO00221 500 aa24.15■■□□□ 1.46
PITX1-204ENST00000504936 LMNB1P20700 586 aa24.14■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 PTPRCP08575 1304 aa24.13■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 PDE8AO60658 829 aa24.13■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 GCKRQ14397 625 aa24.13■■□□□ 1.45
PITX1-204ENST00000504936 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.5 ms