RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.08■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 CAPNS2Q96L46 248 aa18.07■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.06■□□□□ 0.48
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CHTF18-212ENST00000493715 GRM1Q13255 1194 aa18.06■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 PSMD1Q99460 953 aa18.06■□□□□ 0.48
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CHTF18-212ENST00000493715 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.06■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 FAM177BA6PVY3 158 aa18.05■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 RGL2O15211 777 aa18.05■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.03■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.02■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 LTBP1Q14766 1721 aa18.02■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.02■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.02■□□□□ 0.48
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CHTF18-212ENST00000493715 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.02■□□□□ 0.48
CHTF18-212ENST00000493715 SNED1Q8TER0 1413 aa18.01■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NBPF26B4DH59 902 aa18.01■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 RGS19P49795 217 aa18.01■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 RIPK4P57078 832 aa18.01■□□□□ 0.47
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CHTF18-212ENST00000493715 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.01■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NBPF15Q8N660 670 aa18.01■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NYXQ9GZU5 481 aa18.01■□□□□ 0.47
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CHTF18-212ENST00000493715 SCNN1DP51172 638 aa18■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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CHTF18-212ENST00000493715 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 CA12O43570 354 aa17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 MAP2K2P36507 400 aa17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 EPS15P42566 896 aa17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 CRY2Q49AN0 593 aa17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 COL4A5P29400 1685 aa17.99■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 HLFQ16534 295 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NIM1KQ8IY84 436 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 TSKSQ9UJT2 592 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC12Q96J65 1359 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.98■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 TRAF5O00463 557 aa17.97■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 CST9Q5W186 159 aa17.97■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NEUROD2Q15784 382 aa17.96■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.96■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 RUNDC1Q96C34 613 aa17.96■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 TSPYL4Q9UJ04 414 aa17.96■□□□□ 0.47
CHTF18-212ENST00000493715 AOC2O75106 756 aa17.95■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 LMOD3Q0VAK6 560 aa17.95■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.95■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.94■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 PPIP5K2O43314 1243 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 GPRC5DQ9NZD1 345 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.93■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 NGEFQ8N5V2 710 aa17.92■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 HHIPL1Q96JK4 782 aa17.92■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.92■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 NUP98P52948 1817 aa17.92■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 MYL6BP14649 208 aa17.91■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 DGKZQ13574 1117 aa17.91■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 BABAM1Q9NWV8 329 aa17.91■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.91■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 GPTP24298 496 aa17.9■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 AOC3Q16853 763 aa17.9■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 TTLL7Q6ZT98 887 aa17.9■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 VPS33BQ9H267 617 aa17.9■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF408Q9H9D4 720 aa17.9■□□□□ 0.46
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC184Q52MB2 194 aa17.89■□□□□ 0.45
CHTF18-212ENST00000493715 SUPT20HQ8NEM7 779 aa17.89■□□□□ 0.45
CHTF18-212ENST00000493715 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CHTF18-212ENST00000493715 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.89■□□□□ 0.45
CHTF18-212ENST00000493715 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17.89■□□□□ 0.45
CHTF18-212ENST00000493715 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa17.88■□□□□ 0.45
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