RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.54■■□□□ 1.52
NISCH-209ENST00000485765 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NISCH-209ENST00000485765 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.53■■□□□ 1.52
NISCH-209ENST00000485765 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NISCH-209ENST00000485765 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.51■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 C21orf2O43822 256 aa24.5■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.5■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 STK31Q9BXU1 1019 aa24.5■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 ALDH1B1P30837 517 aa24.49■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.49■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 SLC4A2P04920 1241 aa24.48■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 MIER1Q8N108 512 aa24.48■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 SYNE4Q8N205 404 aa24.48■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 NLRP3Q96P20 1036 aa24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 SLX4Q8IY92 1834 aa24.47■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 NFKBIEO00221 500 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 PRELPP51888 382 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 SOGA3Q5TF21 947 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 KSR2Q6VAB6 950 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 G2E3Q7L622 706 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NISCH-209ENST00000485765 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.45■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 RASSF7Q02833 373 aa24.45■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.45■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.44■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 E9PSI1 815 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 LMNB1P20700 586 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 MYD88Q99836 296 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 RNF181Q9P0P0 153 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 SLFN5Q08AF3 891 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 FAM89AQ96GI7 184 aa24.42■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 SBF1O95248 1867 aa24.41■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 FLIIQ13045 1269 aa24.41■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 CCDC93Q567U6 631 aa24.4■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.39■■□□□ 1.5
NISCH-209ENST00000485765 ZNF428Q96B54 188 aa24.39■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 IGKV5-2P06315 115 aa24.38■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 OLFM4Q6UX06 510 aa24.38■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.38■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.38■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 SNED1Q8TER0 1413 aa24.36■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 CACNA1FO60840 1977 aa24.36■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 CACNA1SQ13698 1873 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 BBOX1O75936 387 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 ABCC4O15439 1325 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.34■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 PSMD1Q99460 953 aa24.33■■□□□ 1.49
NISCH-209ENST00000485765 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 LAMB2P55268 1798 aa24.31■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 GRAPQ13588 217 aa24.31■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.31■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 H7C1W4 665 aa24.3■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 PDE8AO60658 829 aa24.3■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 SP8Q8IXZ3 490 aa24.3■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 KIF3CO14782 793 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 SLC51AQ86UW1 340 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 LINS1Q8NG48 757 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NISCH-209ENST00000485765 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.28■■□□□ 1.48
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