RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO3Q9UK99 471 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF165P49910 485 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF5P55010 431 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.32■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP85Q6P2H3 762 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EYA1Q99502 592 aa19.32■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADCY5O95622 1261 aa19.31■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.31■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa19.31■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRM8O00222 908 aa19.31■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TET3O43151 1660 aa19.31■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC5O00471 708 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF652Q9Y2D9 606 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSH6P52701 1360 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBXN4Q92575 508 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQCA1Q86XH1 822 aa19.3■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.29■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.29■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZPR1O75312 459 aa19.29■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC5A1P13866 664 aa19.29■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 G2E3Q7L622 706 aa19.29■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC181Q5TID7 509 aa19.28■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2HP62256 183 aa19.28■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCL2Q8N4E4 241 aa19.28■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa19.27■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.27■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDCL3Q9H2J4 239 aa19.27■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF1BO60333 1816 aa19.27■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP131Q9UPN4 1083 aa19.27■□□□□ 0.68
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K19Q56UN5 1328 aa19.27■□□□□ 0.68
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMX1Q9H3N1 280 aa19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YHG0 523 aa19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOP1P11387 765 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVK-7P63135 1459 aa19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM193AP78312 1265 aa19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP48Q86UV5 1035 aa19.26■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DTNBO60941 627 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPHQ9H3R5 247 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC3O15438 1527 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPOAP1O95153 1857 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPA1P15085 419 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALRP27797 417 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF76P36508 570 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHST3Q7LGC8 479 aa19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNT1P13805 278 aa19.24■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa19.24■□□□□ 0.67
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
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