RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 GPRASP2Q96D09 838 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 BCS1LQ9Y276 419 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 SIAH2O43255 324 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 IRS1P35568 1242 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF21O75509 655 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 MICAL2O94851 1124 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 USP17L7P0C7H9 530 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 GGCXP38435 758 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 NFE2L2Q16236 605 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 NLRP3Q96P20 1036 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-209ENST00000473406 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MEN1O00255 615 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TXLNAP40222 546 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HIF1AQ16665 826 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SPACA7Q96KW9 195 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL1Q15170 157 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 COPRSQ9NQ92 184 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PTGIRP43119 386 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 XKR5Q6UX68 686 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF4Q96M43 638 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NPHS2Q9NP85 383 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PHACTR2O75167 634 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CBLBQ13191 982 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 CLSTN1O94985 981 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD3B2P26439 372 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G4AP47712 749 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IDH3AP50213 366 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 IER5Q5VY09 327 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GPATCH3Q96I76 525 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 BCO2Q9BYV7 579 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNC4Q03721 635 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SERINC3Q13530 473 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 PTPROQ16827 1216 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GNASQ5JWF2 1037 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SPON2Q9BUD6 331 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 ARSDP51689 593 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZVU0 165 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 SUSD3Q96L08 255 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-209ENST00000473406 POTECB2RU33 542 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT7AO00755 349 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 IGBP1P78318 339 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 RELBQ01201 579 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 NNTQ13423 1086 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNB2Q92953 911 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 MKL1Q969V6 931 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ELP3Q9H9T3 547 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-209ENST00000473406 USP20Q9Y2K6 914 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms