RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 NLRP10Q86W26 655 aa37.78■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa37.75■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 CHMP4AQ9BY43 222 aa37.75■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 RNF181Q9P0P0 153 aa37.75■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 RIC1Q4ADV7 1423 aa37.75■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 CCER2I3L3R5 266 aa37.74■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 GOLGA2Q08379 1002 aa37.74■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa37.73■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 RIC3Q7Z5B4 369 aa37.73■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa37.73■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 NFKBIEO00221 500 aa37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 CRY2Q49AN0 593 aa37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 C3orf67Q6ZVT6 689 aa37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 SYNE4Q8N205 404 aa37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 ISCA1Q9BUE6 129 aa37.71■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 STK31Q9BXU1 1019 aa37.71■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 PRELPP51888 382 aa37.7■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
FBXO18-208ENST00000470089 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 LAMB2P55268 1798 aa37.68■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 RNF123Q5XPI4 1314 aa37.68■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 ALDH1B1P30837 517 aa37.68■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF521Q96K83 1311 aa37.67■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 SLC10A5Q5PT55 438 aa37.67■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 NLRP3Q96P20 1036 aa37.67■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 MYH16Q9H6N6 1097 aa37.67■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 LMNB1P20700 586 aa37.66■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 OLFM4Q6UX06 510 aa37.66■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 C7orf43Q8WVR3 580 aa37.66■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 SH3TC1Q8TE82 1336 aa37.65■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 MYD88Q99836 296 aa37.65■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 VAMP4O75379 141 aa37.64■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 DDX58O95786 925 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
FBXO18-208ENST00000470089 SLC4A2P04920 1241 aa37.63■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 SOGA3Q5TF21 947 aa37.63■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 G2E3Q7L622 706 aa37.63■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC93Q567U6 631 aa37.62■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 FAM89AQ96GI7 184 aa37.62■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 TAOK3Q9H2K8 898 aa37.62■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 TIAM2Q8IVF5 1701 aa37.61■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa37.61■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 CACNA1FO60840 1977 aa37.6■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 PI4KAP2A4QPH2 592 aa37.58■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa37.58■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 CRAMP1Q96RY5 1269 aa37.58■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 LTBP3Q9NS15 1303 aa37.58■■■■□ 3.61
FBXO18-208ENST00000470089 KSR2Q6VAB6 950 aa37.57■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 MIER1Q8N108 512 aa37.57■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 SLC51AQ86UW1 340 aa37.55■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 TAF1P21675 1872 aa37.54■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 FLIIQ13045 1269 aa37.53■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 ABCC4O15439 1325 aa37.53■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 RTKN2Q8IZC4 609 aa37.52■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 CCDC191Q8NCU4 936 aa37.52■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.51■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
FBXO18-208ENST00000470089 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 SNED1Q8TER0 1413 aa37.48■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 E9PSI1 815 aa37.48■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 IGKV5-2P06315 115 aa37.48■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 C1QTNF8P60827 252 aa37.48■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.47■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 KIF3CO14782 793 aa37.47■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 NEXNQ0ZGT2 675 aa37.47■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa37.46■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 CDCA7LQ96GN5 454 aa37.46■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 SLFN5Q08AF3 891 aa37.45■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
FBXO18-208ENST00000470089 GRAPQ13588 217 aa37.43■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa37.42■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 GLTPD2A6NH11 291 aa37.41■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 NEURL1BA8MQ27 555 aa37.41■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 DNAAF4Q8WXU2 420 aa37.41■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 PSMD1Q99460 953 aa37.41■■■■□ 3.58
FBXO18-208ENST00000470089 RRAGCQ9HB90 399 aa37.41■■■■□ 3.58
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