RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455157.6

SSUH2-208, Transcript of ssu-2 homolog (C. elegans), human

TSL 2

Gene SSUH2, Length 3,219 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSUH2-208	ENST00000455157	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	TPM3	P06753	285 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	CRB1	P82279	1406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SSUH2-208	ENST00000455157	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PDC	P20941	246 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ME3	Q16798	604 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	FLT4	P35916	1363 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	APP	P05067	770 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LIG1	P18858	919 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PSMA5	P28066	241 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TYRO3	Q06418	890 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	BECN2	A8MW95	431 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NEO1	Q92859	1461 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LRMP	Q12912	555 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NPHP1	O15259	732 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CNPY4	Q8N129	248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TTC14	Q96N46	770 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TNNT1	P13805	278 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF165	P49910	485 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	AOX1	Q06278	1338 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TCHH	Q07283	1943 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CYP2C19	P33261	490 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNQ3	O43525	872 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	AP5Z1	O43299	807 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SSUH2-208	ENST00000455157	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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