RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC12Q96J65 1359 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 C21orf2O43822 256 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH1B1P30837 517 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 CRY2Q49AN0 593 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF428Q96B54 188 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNE4Q8N205 404 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP3Q96P20 1036 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD4Q14839 1912 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 G2E3Q7L622 706 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 KSR2Q6VAB6 950 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 MYD88Q99836 296 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-204ENST00000416021 PI4KAP2A4QPH2 592 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 E9PSI1 815 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM89AQ96GI7 184 aa27.06■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF7Q02833 373 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 SLFN5Q08AF3 891 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 FLIIQ13045 1269 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 SOGA3Q5TF21 947 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF181Q9P0P0 153 aa27.03■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 NFKBIEO00221 500 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC191Q8NCU4 936 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY9O60503 1353 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 LMNB1P20700 586 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 DLEC1Q9Y238 1755 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 PRELPP51888 382 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC93Q567U6 631 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 OLFM4Q6UX06 510 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV5-2P06315 115 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 SLX4Q8IY92 1834 aa26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.95■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 BBOX1O75936 387 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC4O15439 1325 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 F6X3S4 739 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 GRAPQ13588 217 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE8AO60658 829 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 LINS1Q8NG48 757 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C1W4 665 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 GCKRQ14397 625 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 SP8Q8IXZ3 490 aa26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.892e-6■■□□□ 12
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC51AQ86UW1 340 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMD1Q99460 953 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 BEND3Q5T5X7 828 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.86■■□□□ 1.89
SH3BP4-204ENST00000416021 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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