RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 NBPF4Q96M43 638 aa21.48■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 RTL1A6NKG5 1358 aa21.48■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 RBSNQ9H1K0 784 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 DACT1Q9NYF0 836 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 USP44Q9H0E7 712 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.47■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 NAPBQ9H115 298 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 USP16Q9Y5T5 823 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 CBX1P83916 185 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 CHST3Q7LGC8 479 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 KCNQ3O43525 872 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.46■■□□□ 1.03
NOMO3-202ENST00000399336 PLXNC1O60486 1568 aa21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 CFAP100Q494V2 611 aa21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ISM2Q6H9L7 571 aa21.44■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 Q6ZUG5 572 aa21.44■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ANO10Q9NW15 660 aa21.44■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 MICU3Q86XE3 530 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 PALD1Q9ULE6 856 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 SGSM2O43147 1006 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 TFCP2Q12800 502 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 FAM227BQ96M60 508 aa21.43■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.42■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.42■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.42■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC171Q6TFL3 1326 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 KIAA0232Q92628 1395 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.41■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 GPS2Q13227 327 aa21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 TIMM10P62072 90 aa21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.4■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.39■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NOMO3-202ENST00000399336 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 MCM5P33992 734 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 UVSSAQ2YD98 709 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF790Q6PG37 636 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 RUFY3Q7L099 469 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF853P0CG23 659 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 NEO1Q92859 1461 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 MAP3K12Q12852 859 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.39■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PTPN14Q15678 1187 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ADAMTS2O95450 1211 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 TXLNAP40222 546 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PDCL3Q9H2J4 239 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.38■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 SUCLG2Q96I99 432 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 TNNT1P13805 278 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 CLTCL1P53675 1640 aa21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.36■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 SMTNL1A8MU46 457 aa21.36■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.36■■□□□ 1.01
NOMO3-202ENST00000399336 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms