RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa35.08■■■■□ 3.21
GNPTAB-202ENST00000392919 NYXQ9GZU5 481 aa35.08■■■■□ 3.21
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GNPTAB-202ENST00000392919 MYH16Q9H6N6 1097 aa35.06■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 OLFM4Q6UX06 510 aa35.05■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 COPS6Q7L5N1 327 aa35.05■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 TAOK3Q9H2K8 898 aa35.05■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 LTBP3Q9NS15 1303 aa35.05■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 XAGE3Q8WTP9 111 aa35.04■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 GLTPD2A6NH11 291 aa35.03■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 NTSR2O95665 410 aa35.03■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CHPF2Q9P2E5 772 aa35.03■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 CRY2Q49AN0 593 aa35.02■■■■□ 3.2
GNPTAB-202ENST00000392919 SOGA3Q5TF21 947 aa35.02■■■■□ 3.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
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GNPTAB-202ENST00000392919 E9PSI1 815 aa34.99■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 SLFN5Q08AF3 891 aa34.99■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC93Q567U6 631 aa34.99■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.99■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 ALDH1B1P30837 517 aa34.98■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.98■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
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GNPTAB-202ENST00000392919 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.98■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 PARP10Q53GL7 1025 aa34.97■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.96■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.96■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 VAMP4O75379 141 aa34.95■■■■□ 3.19
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.94■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 POTECB2RU33 542 aa34.93■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.93■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC51AQ86UW1 340 aa34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP10Q86W26 655 aa34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 HYPKQ9NX55 129 aa34.92■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP350Q5VT06 3117 aa34.91■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TCIRG1Q13488 830 aa34.91■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF428Q96B54 188 aa34.91■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNE4Q8N205 404 aa34.9■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 SNED1Q8TER0 1413 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR90Q96KV7 1748 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC10A5Q5PT55 438 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 RTKN2Q8IZC4 609 aa34.89■■■■□ 3.18
GNPTAB-202ENST00000392919 DDNO94850 711 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 FSTL1Q12841 308 aa34.87■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP3Q96P20 1036 aa34.87■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 APLP1P51693 650 aa34.86■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.86■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 CRAMP1Q96RY5 1269 aa34.86■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.85■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 STK31Q9BXU1 1019 aa34.84■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMB2P55268 1798 aa34.84■■■■□ 3.17
GNPTAB-202ENST00000392919 SMC1BQ8NDV3 1235 aa34.82■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.81■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC4A2P04920 1241 aa34.81■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 IARSP41252 1262 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBED9Q6R2W3 1325 aa34.81■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 HTRA3P83110 453 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMD1Q99460 953 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF541Q9H0D2 1346 aa34.8■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa34.79■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 SH3TC1Q8TE82 1336 aa34.79■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 G2E3Q7L622 706 aa34.78■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC4O15439 1325 aa34.78■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 COL4A5P29400 1685 aa34.77■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa34.76■■■■□ 3.16
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM89AQ96GI7 184 aa34.74■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
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GNPTAB-202ENST00000392919 POTEIP0CG38 1075 aa34.73■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 POTEJP0CG39 1038 aa34.73■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa34.73■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF1P21675 1872 aa34.73■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.72■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 FLIIQ13045 1269 aa34.71■■■■□ 3.15
GNPTAB-202ENST00000392919 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
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