RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBCK1Q9BYM8 510 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLIQ9UNA4 740 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHF24Q9UPV7 400 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE3BQ13370 1112 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF787Q6DD87 383 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 CITED4Q96RK1 184 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 OPLAHO14841 1288 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFSO43281 561 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 BNIP3LO60238 219 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 VEGFBP49765 207 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNP2Q05952 138 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAMC2Q13753 1193 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 C8orf34Q49A92 452 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 SV2AQ7L0J3 742 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 GJD3Q8N144 294 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASB16Q96NS5 453 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP20Q9Y2K6 914 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR25O00155 361 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERCC3P19447 782 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD33P20138 364 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGFR3P22607 806 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNQ4P56696 695 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 EHHADHQ08426 723 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMC7Q7Z402 723 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM129BQ96TA1 746 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARK1Q9P0L2 795 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BM21 787 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR182O15218 404 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 XYLBO75191 536 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRN4Q9NRL3 753 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NHS1 94 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPEM2Q0P670 501 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEUROD1Q13562 356 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCINQ13939 588 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC16A10Q8TF71 515 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNMA5Q96PV4 448 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 TREHO43280 583 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 EGFRP00533 1210 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSIG8P0DPA2 414 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMP4P12644 408 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIN2CQ14957 1233 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM182BQ5T319 152 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRP13Q86W25 1043 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 RGS22Q8NE09 1264 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELP3Q9H9T3 547 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SASH3O75995 380 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHA2P01877 340 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEFLP07196 543 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 RARAP10276 462 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFKB1P19838 968 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 MX2P20592 715 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK8P45983 427 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAS6Q14393 721 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 COL19A1Q14993 1142 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRF7Q92985 503 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 BHMTQ93088 406 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC30A3Q99726 388 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSX2Q9BZM3 304 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFCC1Q9HA90 598 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCN2Q9UL51 889 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.9 ms