RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 NARFQ9UHQ1 456 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ADRA2BP18089 450 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 STK32BQ9NY57 414 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 MSH5O43196 834 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP10Q86W26 655 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SUCLG2Q96I99 432 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SLC15A2Q16348 729 aa27.33■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 H7C1W4 665 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 HMMRO75330 724 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 RGL2O15211 777 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 CASP7P55210 303 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ATP8B2P98198 1209 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PARP10Q53GL7 1025 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 KAZALD1Q96I82 304 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FAM89AQ96GI7 184 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FAM177BA6PVY3 158 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 SRGAP3O43295 1099 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SUSD4Q5VX71 490 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 GYS1P13807 737 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 MTX1Q13505 466 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SMC5Q8IY18 1101 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 GCC1Q96CN9 775 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SETDB2Q96T68 719 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SSH3Q8TE77 659 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SYNE4Q8N205 404 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 POLA2Q14181 598 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 DCTPP1Q9H773 170 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 NTSR2O95665 410 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 FOXO4P98177 505 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 MYH3P11055 1940 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NFIXQ14938 502 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 APBB1O00213 710 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 SKAP1Q86WV1 359 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NYXQ9GZU5 481 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 LAMB2P55268 1798 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NPHP1O15259 732 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PDE8AO60658 829 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 MSL1Q68DK7 614 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NUCB1Q02818 461 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CTSWP56202 376 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 ERFEQ4G0M1 354 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 TM4SF1P30408 202 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 BCL11AQ9H165 835 aa27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms