RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 FSD1Q9BTV5 496 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A087WZG4 1122 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TTC14Q96N46 770 aa23.37■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A0D9SFI3 127 aa23.36■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 SYCE3A1L190 88 aa23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 STRN4Q9NRL3 753 aa23.35■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TFCP2Q12800 502 aa23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 COL18A1P39060 1754 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 BRINP3Q76B58 766 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TCHHQ07283 1943 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 ERBB4Q15303 1308 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 RBSNQ9H1K0 784 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.33■■□□□ 1.33
TM7SF3-201ENST00000343028 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 A1BGP04217 495 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 IL17RAQ96F46 866 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF26B4DH59 902 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF14Q5TI25 921 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF15Q8N660 670 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NECAB1Q8N987 351 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF445P59923 1031 aa23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NECTIN1Q15223 517 aa23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF214Q8ND24 703 aa23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 USP48Q86UV5 1035 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 SYT1P21579 422 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 TNNI3KQ59H18 835 aa23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3-201ENST00000343028 ME3Q16798 604 aa23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC27A2O14975 620 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 GJB2P29033 226 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 MAP4K1Q92918 833 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 COPRSQ9NQ92 184 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ESPNB1AK53 854 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 STX6O43752 255 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ST3GAL1Q11201 340 aa23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 FIBPO43427 364 aa23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 DCCP43146 1447 aa23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 STK3Q13188 491 aa23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 VPS53Q5VIR6 699 aa23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 TIMM10P62072 90 aa23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.21■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.21■■□□□ 1.31
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms