RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC14Q49A88 953 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CEP57Q86XR8 500 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ACTN2P35609 894 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CAMK4Q16566 473 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D5Q92609 795 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 IL16Q14005 1332 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CNGA4Q8IV77 575 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CNNM3Q8NE01 707 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TSKSQ9UJT2 592 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CTNNA2P26232 953 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF165P49910 485 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 KIF5AQ12840 1032 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 BICDL2A1A5D9 508 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 C8orf76Q96K31 380 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SCLT1Q96NL6 688 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FCHSD2O94868 740 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SKILP12757 684 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF853P0CG23 659 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PPFIA4O75335 1185 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 GNG11P61952 73 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 INSRP06213 1382 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC160A6NGH7 325 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MXRA7P84157 204 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 Q9H521 79 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ATP6V1AP38606 617 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC96Q2M329 555 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CFAP58Q5T655 872 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 INPP5BP32019 993 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FBXO3Q9UK99 471 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PAF1Q8N7H5 531 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CALML4Q96GE6 196 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 VPS18Q9P253 973 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SLFN5Q08AF3 891 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC102BQ68D86 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ARAP1Q96P48 1450 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 ATP8B1O43520 1251 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 AACSQ86V21 672 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 NCOA1Q15788 1441 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 EVI5LQ96CN4 794 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-202ENST00000334414 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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