RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
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RABGGTB-201ENST00000319942 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A10Q6U841 1118 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGGTB-201ENST00000319942 G2E3Q7L622 706 aa12.72□□□□□ -0.37
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A6Q13433 755 aa12.71□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.7□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 RGPD5Q99666 1765 aa12.69□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.69□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 F6X3S4 739 aa12.68□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF787Q6DD87 383 aa12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-201ENST00000319942 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.68□□□□□ -0.38
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC37A3O60309 1634 aa12.67□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.65□□□□□ -0.38
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RABGGTB-201ENST00000319942 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
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RABGGTB-201ENST00000319942 COPS6Q7L5N1 327 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT2Q8IXJ6 389 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 USP44Q9H0E7 712 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTPP1Q9H773 170 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 USP21Q9UK80 565 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGGTB-201ENST00000319942 SLIT2O94813 1529 aa12.6□□□□□ -0.39
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