RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313843.7

STX4-201, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STX4, Length 1,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-201ENST00000313843 LAMB2P55268 1798 aa27.59■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.59■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 MYH3P11055 1940 aa27.59■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 NLRP10Q86W26 655 aa27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.58■■■□□ 2.01
STX4-201ENST00000313843 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 GRM8O00222 908 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 GNAI3P08754 354 aa27.57■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 UTYO14607 1347 aa27.55■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.55■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 SETDB2Q96T68 719 aa27.55■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 FAM177BA6PVY3 158 aa27.54■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 SUSD4Q5VX71 490 aa27.54■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 MSL1Q68DK7 614 aa27.54■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 PARP10Q53GL7 1025 aa27.53■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 AAMPQ13685 434 aa27.52■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 NFIXQ14938 502 aa27.52■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 H7C1W4 665 aa27.51■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 GNAI2P04899 355 aa27.51■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 CASP7P55210 303 aa27.51■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 SUCLG2Q96I99 432 aa27.51■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.51■■■□□ 2
STX4-201ENST00000313843 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 NTSR2O95665 410 aa27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 TM4SF1P30408 202 aa27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 SYNE4Q8N205 404 aa27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 FAM89AQ96GI7 184 aa27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 ZBTB7AO95365 584 aa27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 MTFR1LQ9H019 292 aa27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.49■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.48■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 MMP10P09238 476 aa27.47■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 KAZALD1Q96I82 304 aa27.47■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.46■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 LRP5O75197 1615 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 CEP85Q6P2H3 762 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 NYXQ9GZU5 481 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.45■■□□□ 1.99
STX4-201ENST00000313843 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.45■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 NPHP1O15259 732 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 DDR1Q08345 913 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 SERPINB2P05120 415 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.44■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 ABCC12Q96J65 1359 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.43■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 ERFEQ4G0M1 354 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.42■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 POLD1P28340 1107 aa27.41■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 CNBD1Q8NA66 436 aa27.41■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 SPEF2Q9C093 1822 aa27.41■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 FOXO4P98177 505 aa27.4■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.39■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.39■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.39■■□□□ 1.98
STX4-201ENST00000313843 IGHDP01880 384 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 ATP8B2P98198 1209 aa27.38■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 TAF1P21675 1872 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 ST5P78524 1137 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.37■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 PDE8AO60658 829 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 MTX1Q13505 466 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.36■■□□□ 1.97
STX4-201ENST00000313843 SPON1Q9HCB6 807 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms