RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 ZNF428Q96B54 188 aa25.64■■□□□ 1.7
PARL-201ENST00000311101 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
PARL-201ENST00000311101 C21orf2O43822 256 aa25.63■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.63■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 SBF1O95248 1867 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 RASSF7Q02833 373 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 GOLGA2Q08379 1002 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 CRY2Q49AN0 593 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 SLX4Q8IY92 1834 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 CEP350Q5VT06 3117 aa25.62■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.61■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.61■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 MIER1Q8N108 512 aa25.61■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 SYNE4Q8N205 404 aa25.61■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.61■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 KIF3CO14782 793 aa25.6■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 VAMP4O75379 141 aa25.6■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 STK31Q9BXU1 1019 aa25.6■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.6■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 CACNA1SQ13698 1873 aa25.6■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 NFKBIEO00221 500 aa25.59■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 PRELPP51888 382 aa25.59■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.59■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 G2E3Q7L622 706 aa25.58■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.58■■□□□ 1.69
PARL-201ENST00000311101 SLC4A2P04920 1241 aa25.57■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.57■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 RNF181Q9P0P0 153 aa25.57■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 MYD88Q99836 296 aa25.56■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.56■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 ALDH1B1P30837 517 aa25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 OLFM4Q6UX06 510 aa25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 NLRP3Q96P20 1036 aa25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.55■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.54■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 KSR2Q6VAB6 950 aa25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 FAM89AQ96GI7 184 aa25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.52■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 LMNB1P20700 586 aa25.52■■□□□ 1.68
PARL-201ENST00000311101 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 SOGA3Q5TF21 947 aa25.51■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.51■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 LAMB2P55268 1798 aa25.5■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 FLIIQ13045 1269 aa25.5■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 CCDC93Q567U6 631 aa25.5■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 SLC51AQ86UW1 340 aa25.5■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.5■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 E9PSI1 815 aa25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 SLFN5Q08AF3 891 aa25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 IGKV5-2P06315 115 aa25.48■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 HSPA6P17066 643 aa25.48■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.48■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 ABCC4O15439 1325 aa25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 SNED1Q8TER0 1413 aa25.46■■□□□ 1.67
PARL-201ENST00000311101 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 TOMM70O94826 608 aa25.44■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.44■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.43■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.43■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 RRAGCQ9HB90 399 aa25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 CACNA1FO60840 1977 aa25.42■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 GRAPQ13588 217 aa25.4■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa25.4■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PARL-201ENST00000311101 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.4■■□□□ 1.66
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