RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296122.10

PPP1CB-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CB, Length 3,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-201ENST00000296122 RABEP1Q15276 862 aa15.97■□□□□ 0.15
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PPP1CB-201ENST00000296122 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
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PPP1CB-201ENST00000296122 SASH1O94885 1247 aa15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 BICDL1Q6ZP65 573 aa15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 NLRP10Q86W26 655 aa15.91■□□□□ 0.14
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PPP1CB-201ENST00000296122 SLIT2O94813 1529 aa15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 PDE8AO60658 829 aa15.9■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PPP1CB-201ENST00000296122 FAM182BQ5T319 152 aa15.9■□□□□ 0.14
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PPP1CB-201ENST00000296122 NEK4P51957 841 aa15.89■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 AK7Q96M32 723 aa15.89■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.89■□□□□ 0.13
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PPP1CB-201ENST00000296122 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.89■□□□□ 0.13
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PPP1CB-201ENST00000296122 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 RNF20Q5VTR2 975 aa15.89■□□□□ 0.13
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PPP1CB-201ENST00000296122 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 GNPATO15228 680 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 ITGA6P23229 1130 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 FOXO4P98177 505 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 FBXO3Q9UK99 471 aa15.88■□□□□ 0.13
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PPP1CB-201ENST00000296122 CCDC152Q4G0S7 254 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.88■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 SNX21Q969T3 373 aa15.87■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 MCM2P49736 904 aa15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 TIMM10P62072 90 aa15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 37.1
PPP1CB-201ENST00000296122 CIAO1O76071 339 aa15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PPP1CB-201ENST00000296122 RFC4P35249 363 aa15.86■□□□□ 0.13
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