RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 CNTROBQ8N137 903 aa26.25■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.25■■□□□ 1.79
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SNRNP25-201ENST00000293861 C8orf37Q96NL8 207 aa26.24■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 TCIRG1Q13488 830 aa26.24■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.22■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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SNRNP25-201ENST00000293861 AACSQ86V21 672 aa26.22■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.21■■□□□ 1.79
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SNRNP25-201ENST00000293861 FOXO4P98177 505 aa26.21■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 CERKQ8TCT0 537 aa26.21■■□□□ 1.79
SNRNP25-201ENST00000293861 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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SNRNP25-201ENST00000293861 IL17RAQ96F46 866 aa26.19■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 SIL1Q9H173 461 aa26.19■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.19■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 DDIT3P35638 169 aa26.18■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.18■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.18■■□□□ 1.78
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.18■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP98P52948 1817 aa26.17■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 ANAPC15P60006 121 aa26.17■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 MCCP23508 829 aa26.16■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.16■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 RREB1Q92766 1687 aa26.15■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 SGSM2O43147 1006 aa26.15■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 EVI5LQ96CN4 794 aa26.15■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.15■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.14■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 A0A0G2JS52 829 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 SIK1P57059 783 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 USP21Q9UK80 565 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 PALLDQ8WX93 1383 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.13■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 ST18O60284 1047 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 IL27Q8NEV9 243 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 IL25Q9H293 177 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP6V1AP38606 617 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 TNNI3KQ59H18 835 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.12■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 MYH3P11055 1940 aa26.11■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.11■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 ARXQ96QS3 562 aa26.11■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 TFCP2Q12800 502 aa26.1■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.1■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.1■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.1■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 HLFQ16534 295 aa26.1■■□□□ 1.77
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SNRNP25-201ENST00000293861 RAD50Q92878 1312 aa26.09■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 GPR108Q9NPR9 543 aa26.09■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 HIP1O00291 1037 aa26.08■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 HSPA4P34932 840 aa26.08■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP10Q86W26 655 aa26.08■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.08■■□□□ 1.77
SNRNP25-201ENST00000293861 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.08■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 CIAO1O76071 339 aa26.07■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 ATP5JP18859 108 aa26.07■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 KCNQ2O43526 872 aa26.06■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 FBXO3Q9UK99 471 aa26.06■■□□□ 1.76
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SNRNP25-201ENST00000293861 ITPK1Q13572 414 aa26.06■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 PALD1Q9ULE6 856 aa26.06■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM89AQ96GI7 184 aa26.05■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 EYA2O00167 538 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 SNRKQ9NRH2 765 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 CSF1RP07333 972 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM2P49736 904 aa26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.04■■□□□ 1.76
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