RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cfap58B2RW38 873 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm7361D3Z6R1 267 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 PnnO35691 725 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sema3fO88632 785 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 F2rP30558 430 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rnf20Q5DTM8 973 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Txndc2Q6P902 515 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zscan22Q8BGS5 496 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gpatch3Q8BIY1 525 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cdk19Q8BWD8 501 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 RictorQ6QI06 1708 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Scn4aQ9ER60 1841 aa5.46□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Col22a1E9Q7P1 1613 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Frat1P70339 274 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tpm4Q6IRU2 248 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Atl2Q6PA06 583 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gimap8Q75N62 688 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Aldh1l2Q8K009 923 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mdc1Q5PSV9 1707 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mtx1P47802 317 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rgl2Q61193 778 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mum1Q6DID5 682 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Bank1Q80VH0 783 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cep57l1Q8VDS7 400 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Slc52a2Q9D8F3 450 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Syt1P46096 421 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Oxsr1Q6P9R2 527 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rimbp2Q80U40 1072 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ctage5Q8R311 779 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Syt10Q9R0N4 523 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Bcl9Q9D219 1425 aa5.45□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ppp1r15aP17564 657 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tm6sf1P58749 370 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Uri1Q3TLD5 531 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nrbp1Q99J45 535 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pik3r4Q8VD65 1358 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Topaz1E5FYH1 1653 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kif1aP33173 1695 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 NalcnQ8BXR5 1738 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zscan29E9Q5B4 869 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kank4Q6P9J5 1016 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Jade2Q6ZQF7 829 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Wdr24Q8CFJ9 790 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Brf1Q8CFK2 676 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Sugp2Q8CH09 1067 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lman1Q9D0F3 517 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 NbnQ9R207 751 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Naip7Q9JIB3 1402 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mcm6P97311 821 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Irf6P97431 467 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 GapdhsQ64467 440 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmco3Q8BH01 678 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Vps18Q8R307 973 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa5.44□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 OvosQ3UU35 1456 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Evi5lH3BKQ3 813 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Map9Q3TRR0 646 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ccdc34Q3UI66 367 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mical1Q8VDP3 1048 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Jakmip2D3YXK0 820 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ano10Q8BH79 659 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pnpla2Q8BJ56 486 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tceanc2Q8R2M0 207 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmx1Q8VBT0 278 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ifi35Q9D8C4 286 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Calr3Q9D9Q6 380 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mlh1Q9JK91 760 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cnpy2Q9QXT0 182 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Med1Q925J9 1575 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Zfp597E9Q6S0 419 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 NefhP19246 1090 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ms4a1P19437 291 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Irx2P81066 474 aa5.43□□□□□ -1.54
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.4 ms