Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
Sema3fO88632 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Sema3fO88632 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Sema3fO88632 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Sema3fO88632 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Sema3fO88632 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Sema3fO88632 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Sema3fO88632 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Sema3fO88632 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Sema3fO88632 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Sema3fO88632 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Sema3fO88632 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Sema3fO88632 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Sema3fO88632 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Sema3fO88632 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sema3fO88632 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Sema3fO88632 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Sema3fO88632 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Sema3fO88632 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Sema3fO88632 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Sema3fO88632 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Sema3fO88632 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sema3fO88632 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Sema3fO88632 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Sema3fO88632 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sema3fO88632 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Sema3fO88632 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Sema3fO88632 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sema3fO88632 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sema3fO88632 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Sema3fO88632 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Sema3fO88632 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Sema3fO88632 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Sema3fO88632 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Sema3fO88632 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Sema3fO88632 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Sema3fO88632 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Sema3fO88632 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Sema3fO88632 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sema3fO88632 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Sema3fO88632 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sema3fO88632 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sema3fO88632 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sema3fO88632 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sema3fO88632 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sema3fO88632 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sema3fO88632 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Sema3fO88632 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sema3fO88632 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sema3fO88632 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Sema3fO88632 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sema3fO88632 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sema3fO88632 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Sema3fO88632 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sema3fO88632 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Sema3fO88632 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sema3fO88632 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sema3fO88632 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Sema3fO88632 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sema3fO88632 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sema3fO88632 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Sema3fO88632 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sema3fO88632 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sema3fO88632 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema3fO88632 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Sema3fO88632 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sema3fO88632 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sema3fO88632 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sema3fO88632 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sema3fO88632 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sema3fO88632 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sema3fO88632 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sema3fO88632 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sema3fO88632 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sema3fO88632 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sema3fO88632 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sema3fO88632 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Sema3fO88632 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Sema3fO88632 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sema3fO88632 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sema3fO88632 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sema3fO88632 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sema3fO88632 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Sema3fO88632 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Sema3fO88632 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sema3fO88632 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sema3fO88632 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Sema3fO88632 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Sema3fO88632 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Sema3fO88632 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sema3fO88632 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sema3fO88632 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sema3fO88632 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sema3fO88632 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sema3fO88632 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms