RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000152170.7

Pdss1-207, Transcript of Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdss1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Clca2Q8BG22 942 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Stard3nlQ9DCI3 235 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ehd4Q9EQP2 541 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cyp7a1Q64505 503 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam122aQ9DB52 284 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gm7347D3YYI9 267 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Speer4aF8VPX6 267 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Psd3Q2PFD7 1037 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 CfhP06909 1234 aa27.3■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ttc41Q692V3 1318 aa27.3■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NmiO35309 314 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Fam213aQ9CYH2 218 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nectin2P32507 530 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Aifm3Q3TY86 605 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rapgefl1Q68EF8 662 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 WaslQ91YD9 501 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 XpcP51612 930 aa27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ripor2Q80U16 1078 aa27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Tmco5bQ80X59 307 aa27.26■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ttc14Q9CSP9 761 aa27.26■■□□□ 1.96
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Flt1P35969 1333 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Csf1rP09581 977 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 HellsQ60848 821 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Pcsk7Q61139 770 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Insm1Q63ZV0 521 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ttc19Q8CC21 365 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cyp2ab1S4R196 498 aa27.25■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa27.24■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Nup188Q6ZQH8 1759 aa27.24■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 EappQ5BU09 281 aa27.23■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 BcanQ61361 883 aa27.23■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Bend3Q6PAL0 825 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Greb1lB9EJV3 1913 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Znf609Q8BZ47 1413 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Znf428Q8C1M2 176 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zbtb38Q3LR78 1197 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zap70P43404 618 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map3k9Q3U1V8 1077 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 UvssaQ9D479 717 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Stk32bQ9JJX8 414 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NpcdF8VQB8 469 aa27.19■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa27.19■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gpr101Q80T62 511 aa27.19■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Adarb2Q9JI20 745 aa27.19■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map3k13Q1HKZ5 959 aa27.18■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Btaf1E9QAE3 1848 aa27.18■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Oas2E9Q9A9 742 aa27.17■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Trim34bJ3QNR8 485 aa27.17■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 L3mbtl2P59178 703 aa27.17■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Vil1Q62468 827 aa27.17■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Chrna5Q2MKA5 467 aa27.16■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Kif2cQ922S8 721 aa27.16■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Dydc2Q9D3X8 139 aa27.16■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Lgr5Q9Z1P4 907 aa27.16■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ric3Q8BPM6 367 aa27.15■■□□□ 1.94
Pdss1-207ENSMUST00000152170 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rps8P62242 208 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 NfixP70257 488 aa27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Col24a1Q30D77 1733 aa27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Setdb1O88974 1307 aa27.13■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Myo3bQ1EG27 1305 aa27.12■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 PnnO35691 725 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Usp48Q3V0C5 1052 aa27.11■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Myoz2Q9JJW5 264 aa27.11■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Map3k15A2AQW0 1331 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 UtrnE9Q6R7 3430 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Grm8P47743 908 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Q3UPC7 1272 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 VeztQ3ZK22 780 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Popdc2Q9ES82 367 aa27.1■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Scn9aQ62205 1984 aa27.09■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Zfp646Q6NV66 1788 aa27.09■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Naa16Q9DBB4 864 aa27.09■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa27.08■■□□□ 1.93
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Ltn1Q6A009 1767 aa27.07■■□□□ 1.92
Pdss1-207ENSMUST00000152170 HlfQ8BW74 295 aa27.07■■□□□ 1.92
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Slc34a2Q9DBP0 697 aa27.07■■□□□ 1.92
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Gnat3Q3V3I2 354 aa27.06■■□□□ 1.92
Pdss1-207ENSMUST00000152170 Itga6Q61739 1091 aa27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.2 ms