RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc162pQ0VG85 912 aa26.06■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Leo1Q5XJE5 667 aa26.06■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mx2Q9WVP9 655 aa26.06■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa26.05■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mdm2P23804 489 aa26.05■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnf20Q5DTM8 973 aa26.05■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc66Q6NS45 935 aa26.05■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dzip1Q8BMD2 852 aa26.05■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RubcnlQ3TD16 648 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Babam1Q3UI43 333 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TkfcQ8VC30 578 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnks1bp1P58871 1720 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MecomP14404 1042 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa26.04■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FanccP50652 591 aa26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nap1l3Q794H2 544 aa26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tns2Q8CGB6 1400 aa26.03■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Evi5lH3BKQ3 813 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ThemisQ8BGW0 636 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tsr2Q8C8T8 191 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Phkg2Q9DB30 406 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hmg20bQ9Z104 317 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mst1rQ62190 1378 aa26.02■■□□□ 1.76
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 InsrrQ9WTL4 1300 aa26.01■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AceP09470 1312 aa26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chmp7Q8R1T1 451 aa26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tceanc2Q8R2M0 207 aa26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wnk3Q80XP9 1757 aa26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep57l1Q8VDS7 400 aa26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr78E9PYY5 807 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rps6ka5Q8C050 863 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ric1Q69ZJ7 1422 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 OptnQ8K3K8 584 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tubb6Q922F4 447 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TefQ9JLC6 301 aa25.99■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll7A4Q9F0 912 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp25P57080 1055 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc27Q8CD92 847 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slit1Q80TR4 1531 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxl16A2RT62 479 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MyclP10166 368 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnajc5P60904 198 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem87bQ8BKU8 555 aa25.98■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnnm3Q32NY4 713 aa25.97■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adora1Q60612 326 aa25.97■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inpp5bQ8K337 993 aa25.97■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DbnlQ62418 436 aa25.96■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snx13Q6PHS6 957 aa25.96■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mmel1Q9JLI3 765 aa25.96■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MypnQ5DTJ9 1315 aa25.96■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa25.96■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CrklP47941 303 aa25.95■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnnm1Q0GA42 951 aa25.95■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GpkowQ56A08 488 aa25.95■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prkab2Q6PAM0 271 aa25.95■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ripor2Q80U16 1078 aa25.95■■□□□ 1.75
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap157Q0VFX2 523 aa25.95■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Me3Q8BMF3 604 aa25.95■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zkscan7E9PVW1 718 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif3aP28741 701 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Oxsr1Q6P9R2 527 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nek11Q8C0Q4 628 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plcd1Q8R3B1 756 aa25.94■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hspa2P17156 633 aa25.93■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ctdnep1Q3TP92 244 aa25.92■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bmp2kQ91Z96 1138 aa25.92■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FocadA2AKG8 1798 aa25.92■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kcna6Q61923 529 aa25.92■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stat1P42225 749 aa25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Jarid2Q62315 1234 aa25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plcd3Q8K2J0 785 aa25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Farp2Q91VS8 1065 aa25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ZwintQ9CQU5 252 aa25.91■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cspp1B2RX88 1205 aa25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CgnP59242 1191 aa25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Neurod6P48986 337 aa25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tyro3P55144 880 aa25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt85Q9Z2T6 507 aa25.9■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa25.89■■□□□ 1.74
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NmiO35309 314 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.4 ms