RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 NR5A2O00482 541 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 KRT75O95678 551 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C1QCP02747 245 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 GUSBP08236 651 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 CAPN3P20807 821 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ATP6V1C1P21283 382 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 CASP6P55212 293 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C3AR1Q16581 482 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MARCH3Q86UD3 253 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 RNF130Q86XS8 419 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FADS6Q8N9I5 356 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FAM57AQ8TBR7 257 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 HOXD1Q9GZZ0 328 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SLC6A15Q9H2J7 730 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 LDAHQ9H6V9 325 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 HHATLQ9HCP6 504 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MRGBPQ9NV56 204 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 EXD2Q9NVH0 621 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FBXL2Q9UKC9 423 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.58■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 NPIPB9F8W1W9 429 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZNHIT1O43257 154 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ANP32DO95626 131 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ANGPTL1O95841 491 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 OR12D1P0DN82 309 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 CASP9P55211 416 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C17orf67Q0P5P2 114 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TSPEARQ8WU66 669 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 OR2B2Q9GZK3 357 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF350Q9GZX5 532 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TINAGQ9UJW2 476 aa18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PCNX3Q9H6A9 2034 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 A0A096LPI6 279 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 A0A1W2PP18 115 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C17orf51A8MQB3 221 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 HMGN4O00479 90 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PRRG2O14669 202 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 BCKDKO14874 412 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 LRRTM2O43300 516 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 STX11O75558 287 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TRAPPC6AO75865 159 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 CD1EP15812 388 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SRD5A2P31213 254 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DCTP40126 519 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MVDP53602 400 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 GTDC1Q4AE62 458 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FLYWCH1Q4VC44 716 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 OR5M10Q6IEU7 315 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C16orf62Q7Z3J2 963 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 MISPQ8IVT2 679 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 OR2M3Q8NG83 312 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 OR4K17Q8NGC6 315 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 RAB8BQ92930 207 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 POLE3Q9NRF9 147 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SPRR3Q9UBC9 169 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa18.56■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SCDO00767 359 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 NDUFB5O43674 189 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 AGFG2O95081 481 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 HPGDP15428 266 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ATP12AP54707 1039 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 FUT5Q11128 374 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 STX5Q13190 355 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 TOMM20Q15388 145 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 KLHL26Q53HC5 615 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 EIPR1Q53HC9 387 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 NHSL2Q5HYW2 709 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 PAGE3Q5JUK9 113 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 COX20Q5RI15 118 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 CD163Q86VB7 1156 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF527Q8NB42 609 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 C10orf82Q8WW14 230 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 SARAFQ96BY9 339 aa18.55■□□□□ 0.56
CLDN3-201ENST00000395145 DSN1Q9H410 356 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms