RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 NUBPLQ8TB37 319 aa16.78■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 SLC35A4Q96G79 324 aa16.78■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 WWTR1Q9GZV5 400 aa16.78■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.78■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 CLDN1O95832 211 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ARAFP10398 606 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 DRD5P21918 477 aa16.77■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 NPSR1Q6W5P4 371 aa16.77■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 MICU2Q8IYU8 434 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 TMEM156Q8N614 296 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.77■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.77■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 RELTQ969Z4 430 aa16.76■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 GPR137Q96N19 417 aa16.76■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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PTX4-201ENST00000293922 ACOX3O15254 700 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 GGT1P19440 569 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 SCARB2Q14108 478 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 GNA13Q14344 377 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.74■□□□□ 0.27
PTX4-201ENST00000293922 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.74■□□□□ 0.27
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