RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EMBQ6PCB8 327 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF550Q7Z398 422 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 P3H2Q8IVL5 708 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OR14L1PQ8NHC6 308 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RNF138Q8WVD3 245 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 IFT81Q8WYA0 676 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 FIG4Q92562 907 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PERPQ96FX8 193 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF681Q96N22 645 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP3Q96NJ6 502 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PIP5K1AQ99755 562 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TM9SF2Q99805 663 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PIGMQ9H3S5 423 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 VIPAS39Q9H9C1 493 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 WDR41Q9HAD4 459 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R10Q9NYW0 307 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 JMJD1CQ15652 2540 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ARID1AO14497 2285 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PPP6CO00743 305 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CASKO14936 926 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TO15178 435 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF9O43307 516 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RAD51CO43502 376 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN2O60636 221 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 UGDHO60701 494 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA3DO95025 777 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CGAP01215 116 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ATP1B1P05026 303 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GFAPP14136 432 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 KRT15P19012 456 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CRYGSP22914 178 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CRABP2P29373 138 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SRD5A2P31213 254 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MC3RP41968 323 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PHEXP78562 749 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TRAF3Q13114 568 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SNTA1Q13424 505 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CASP8Q14790 479 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ACKR1Q16570 336 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 MROH9Q5TGP6 573 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC24Q6UX98 284 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 IFNEQ86WN2 208 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 METTL4Q8N3J2 472 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TMBIM1Q969X1 311 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINI1Q99574 410 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ERP44Q9BS26 406 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 WHRNQ9P202 907 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM29Q9UKF5 820 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 ACOT9Q9Y305 439 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXD8-202ENST00000429017 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.9□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087X1B8 175 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 FRG2CA6NGY1 282 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 SYCE1LA8MT33 242 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ACOX3O15254 700 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 CDH16O75309 829 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXD8-202ENST00000429017 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms