RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 HAO1Q9UJM8 370 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 A8MVJ9 347 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NME2P1O60361 137 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PEX11AO75192 247 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CBX6O95503 412 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NME2P22392 152 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 LYPD8Q6UX82 237 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HDXQ7Z353 690 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BCORP1Q8N888 145 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SH3GL2Q99962 352 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 HPF1Q9NWY4 346 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 DTX4Q9Y2E6 619 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NBASA2RRP1 2371 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ASPDHA6ND91 283 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 WISP2O76076 250 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CBX7O95931 251 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 BCKDHAP12694 445 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PCSK2P16519 638 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MST1P26927 711 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TDGF1P3P51864 188 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TTMPQ5BVD1 217 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C16orf52Q8NHV5 167 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ZNF675Q8TD23 568 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 TSSK3Q96PN8 268 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.53□□□□□ -0.08
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ACTB-206ENST00000443528 OLAHQ9NV23 265 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 RELNP78509 3460 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 FLNCQ14315 2725 aa14.52□□□□□ -0.08
ACTB-206ENST00000443528 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 LRATO95237 230 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 GPX3P22352 226 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 MPIP34949 423 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ZNF385BQ569K4 471 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 OPN5Q6U736 354 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SULF2Q8IWU5 870 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SLC15A4Q8N697 577 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NR4A3Q92570 626 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KAT2AQ92830 837 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 TP53INP1Q96A56 240 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FRMD6Q96NE9 622 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 BBS4Q96RK4 519 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CLMPQ9H6B4 373 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.52□□□□□ -0.09
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ACTB-206ENST00000443528 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PNPOQ9NVS9 261 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 AKAP10O43572 662 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 TBX19O60806 448 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SASH3O75995 380 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FBXO45P0C2W1 286 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 EMDP50402 254 aa14.51□□□□□ -0.09
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