RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C COT1P32798 439 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ATG19P35193 415 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C YHL017WP38745 532 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C CCC2P38995 1004 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ISM1P48526 1002 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data7.79□□□□□ -1.16not detected
SPE3YPR069C YOR022CQ12204 715 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SMC6Q12749 1114 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C TEL1P38110 2787 aa7.79□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C CSE2P33308 149 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C MRX3P38172 270 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C YEL023CP39992 682 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C MOB1P40484 314 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C YGR153WP48238 217 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C MNP1P53163 194 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C YGR130CP53278 816 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C RTT102P53330 157 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C PGA2P53903 129 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ECM7Q06200 448 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SGO1Q08490 590 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C IES4Q08561 116 aa7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C GET3Q12154 354 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C COX4P04037 155 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RSA4P25382 515 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CCL1P37366 393 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C DSF2P38213 736 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C LEO1P38439 464 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RPN3P40016 523 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C AVT1P47082 602 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YNL146WP53906 100 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C MRI1Q06489 411 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YLH47Q06493 454 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C IRC10Q08118 586 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C PSK2Q08217 1101 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YOR296WQ08748 1289 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C DCS2Q12123 353 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C MNL2Q12205 849 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RLF2Q12495 606 aa7.77□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ADE4P04046 510 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SNF1P06782 633 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ALG1P16661 449 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C GCS1P35197 352 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RIM4P38741 713 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C XDJ1P39102 459 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C BUD6P41697 788 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YDR344CQ05510 147 aa7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HSP82P02829 709 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HOP09932 586 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C APE1P14904 514 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CKA2P19454 339 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C BET2P20133 325 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RAD54P32863 898 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SKG6P32900 734 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C PEX28P38848 579 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C NUP82P40368 713 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YIR016WP40572 265 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C MAF1P41910 395 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SDA1P53313 767 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CBK1P53894 756 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C OSW2Q12202 724 aa7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data7.74□□□□□ -1.17not detected
SPE3YPR069C RNR2P09938 399 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YEL076C-AP0CX16 216 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YLR464WP0CX17 216 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C DBP5P20449 482 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HMT1P38074 348 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SIP3P38717 1229 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YEL076CP39971 216 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C MGA2P40578 1113 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CUL3P53202 744 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C TPO2P53283 614 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C FAR11P53917 953 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C SDH5Q08230 162 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RRD2Q12461 358 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C NBL1Q3E7Y6 73 aa7.74□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C TUF1P02992 437 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HXK1P04806 485 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HAP2P06774 265 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C TOM70P07213 617 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ATP1P07251 545 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C FRS2P15625 503 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CYS3P31373 394 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C VPS35P34110 944 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C HEL1P36113 551 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C PGM2P37012 569 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C PIH1P38768 344 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C YER186CP40101 306 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C CTF18P49956 741 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C ENV11P53246 860 aa7.73□□□□□ -1.17
SPE3YPR069C RTC4P53850 401 aa7.73□□□□□ -1.17
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