RNA–Protein interactions for RNA: YOR094W

ARF3, Transcript of Glucose-repressible ADP-ribosylation factor, yeast

Gene ARF3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARF3	YOR094W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	PNS1	Q12412	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	SPE1	P08432	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	ATG19	P35193	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	CCC2	P38995	1004 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
ARF3	YOR094W	GYP7	P48365	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	SRP101	P32916	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	NPP2	P39997	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	MSE1	P48525	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	PHO23	P50947	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	MRP8	P35719	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	EXG2	P52911	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	PRI2	P20457	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	YKL069W	P36088	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	SFB2	P53953	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	SUN4	P53616	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ARF3	YOR094W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	VAC8	P39968	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YER158C	P40095	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	IRR1	P40541	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	AIM21	P40563	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	NCS6	P53088	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	ADE8	P04161	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	SIT1	P39980	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YKE2	P52553	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	ENB1	Q08299	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	GUP2	Q08929	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	NPC2	Q12408	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	PPH3	P32345	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	SCT1	P32784	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	MSS4	P38994	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	TPO2	P53283	614 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	SLI1	P53304	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	CTF4	Q01454	927 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	CHS7	P38843	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	AIM39	Q08223	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	NPP1	P25353	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	AFR1	P33304	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	UPC2	Q12151	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	KAR4	P25583	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	STE5	P32917	917 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YRO2	P38079	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	KIN4	Q01919	800 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	YBR184W	P38299	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	LAS17	Q12446	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ARF3	YOR094W	SED4	P25365	1065 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	STE14	P32584	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	STE13	P33894	931 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	VPS30	Q02948	557 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	LCD1	Q04377	747 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	FBP1	P09201	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	PFD1	P46988	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	CDC11	P32458	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	FMP25	Q08023	583 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	REC104	P33323	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	KTR4	P38131	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	TOK1	P40310	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	BUL1	P48524	976 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	SPO75	Q07798	868 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	ALR2	P43553	858 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	GIS1	Q03833	894 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	RAD53	P22216	821 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ARF3	YOR094W	SDP1	P40479	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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