RNA–Protein interactions for RNA: YNL109W

YNL109W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL109W, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL109W	YNL109W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	ADY3	Q07732	790 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	CTS1	P29029	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	PPH3	P32345	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	GIC1	P38785	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	CCC2	P38995	1004 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL109W	YNL109W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	CDC11	P32458	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	LST4	P34239	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	CHA4	P43634	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YAP6	Q03935	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SPO75	Q07798	868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	XYL2	Q07993	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	TRM2	P33753	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YKL069W	P36088	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SIT1	P39980	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YER158C	P40095	573 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	GCV2	P49095	1034 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	CDA1	Q06702	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SPE1	P08432	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	HCM1	P25364	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	PLB1	P39105	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	VPS30	Q02948	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	TMA10	Q06177	86 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	DCG1	P32460	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SRP101	P32916	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	IOC4	Q04213	475 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YRO2	P38079	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YBR184W	P38299	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YJL049W	P47048	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	GUP2	Q08929	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	YKE2	P52553	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	ERP6	P53198	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SFB2	P53953	876 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	LCD1	Q04377	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YNL109W	YNL109W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	FMP25	Q08023	583 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	ENB1	Q08299	606 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NTO1	Q12311	748 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	STE5	P32917	917 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NPP2	P39997	493 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	EXG2	P52911	562 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	EAF1	Q06337	982 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	PNS1	Q12412	539 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	REC104	P33323	182 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	ALR2	P43553	858 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	PFD1	P46988	109 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	MSE1	P48525	536 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NCS6	P53088	359 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	PUS9	Q12069	462 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NPP1	P25353	742 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	SED4	P25365	1065 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	STE13	P33894	931 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	AIM39	Q08223	395 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	NPC2	Q12408	173 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	ARE1	P25628	610 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	AIM21	P40563	679 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	HUL4	P40985	892 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	UPC2	Q12151	913 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	AFR1	P33304	620 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
YNL109W	YNL109W	PHO23	P50947	330 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YNL109W	YNL109W	RAD4	P14736	754 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	PET10	P36139	283 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	TOK1	P40310	691 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	NIT3	P49954	291 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	CIT1	P00890	479 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YNL109W	YNL109W	TIM54	P47045	478 aa		4.45	□□□□□ -1.7

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.4 ms